По другом делу манге Нарута, направљен је и аниме, Наруто Шипуден, који прати Нарута као петнаестогодишњака, где се он после две и по године тренирања са Џирајом, враћа у Коноху, спреман за обрачун са групом Акацуки. На почетку има задатак да спаси вођу Сунагакуреа, Казекагеа, и свог пријатеља Гаару. Обрачунава се са члановима групе Акацуки по имену Деидара и Сасори. Након успешног завршетка мисије његов тим Тим Какаши добија нове чланове. Уместо Какашија који је повређен долази АНБУ оперативацYамато, а уместо Саскеа долази такође АНБУ оперативац Сај. Нови тим Какаши добија мисију да врати Саскеа у село Коноха. Тада се први пут после 2 и по година сретне са Саскеом. Након те мисије доази 1. поглавље не издато у манги. Након тога поново се обрачунава са групом Акацуки сада са Хиданом и Какузуом. Наруто тада учи једну од најјачих техника : Фуутон : Расен-Схурикен (Фуутон : Расен-Шурикен). Након тог поглавља, Наруто се обрацунава са Акацукијем у нади да це његово село заробити Санбија (Чудовиша корњача са 3 репа). Али Акацуки добија и Санбија. Након тог поглавља Саске уништава Орочимаруа и оснује свој Тим од 4 члана : Њега,Суигецуа, Карин и Југоа. Тим се зове Хеби. Њихов главни циљ је елиминисање Саскеовог брата Итачија Учихе. Саске налази свог брата и уништава га, али тада се умеша Тоби који се открива као Мадара Учиха. Наговара Саскеа да уђе у групу Акацуки. Он пристаје. Тада његов тим добија име Така. Први задатак био им је да заробе Џинчурикија Хачибија (бика-хоботницу са 8 репова) Килер Бија. Након тешке битке Саскеов тим побеђује, али испоставило се да је то лажњак. Након тога, Така не жели да има посла са Акацукијем. После следи поглавље о Ђжинчурикијем Рокубија (црва са 6 репа), младића по имену Утаката. Све делује као да на крају поглавље има срећан крај али на крају 6 Пеина заробе и овог Џинчурикија, тако да су сада остала само 2 активна Џинчурикија: Наруто и Килер Би.

12 година пре дешавања радње у серијалу, Демонска лисица са девет репова (касније названа Кјуби) напада село Конохагакуре. То је био веома моћан демон који је изазивао цунамије и убијао много нинџи које су покушавале да заштите своје село. Изазивао хаос међу сељанима, све док га вођа Конохе, Четврти Хокаге, није запечатио у тек рођеног дечака, жртвојући свој живот. То дете је био управо главни јунак серије, Наруто Узумаки. Сви у селу су славили Четвртог Хокагеа као хероја њиховог села због печаћења Деветорепе Демонске Лисице. Међутим, Четврти Хокаге је највише желео да Нарута поштују као хероја који је заштитио село од ове звери, па је зато забранио да се према њему понашају ружно због звери коју он носи у себи. Међутим, Хокагеово наређење бива одбијено, па је Наруто у већем делу свог детињства био малтретиран од стране деце са Академије.
Трећи Хокаге говори становницима Конохе да Нарута треба да сматрају једнаким себи и да га третирају као свако друго, обично дете. Али ни то није помогло да Наруто буде прихваћен. Наруто одраста без родитеља и пријатеља. Да би привукао пажњу људи он је правио разне шале и глупости. Ускоро Наруто дипломира на Нинџа Академији користећи технику Техника Клона Сенке (јап. Тајū Каге Бунсхин но Јутсу, енг.Мултипле Схадоw Цлоне Тецхниqуе) како би спасао свог учитеља Ируку од одбеглог нинџе Мизукија. То спашавање Наруту отвара поглед на свет. Иако у себи има Кјубија, Наруто схвата да ипак постоји особа која брине о њему, а то је његов учитељ Ирука. Када је коначно дипломирао на Нинџа Академији, Наруто упознаје пуно пријатеља и он себи одређује један циљ у животу: Да постане најбољи нинџа који ће бити поштован и вољен у своме селу.
Овај аниме се може представити као мешавина драме и комедије са пуно акције. Серијал се заснива на Наруту и његовим пријатељима, говори о њиховом одрастању, сукобљавању, заједничкој борби за живот и, наравно, првим љубавима. Први пријатељи Нарута су Учиха Сасуке иХаруно Сакура, двоје тинејџера који су уврштени са Нарутом у тим од три члана под вођством искусног учитеља Хатаке Какашија. Наруто је у току Чунин испита стекао још много пријатеља, који ће му помоћи да оствари свој сан.
Наравно, како то увек бива, сукобљавају се добро и зло. Неколико негативаца долазе до изражаја, као што су то Забуза Момочи и Хаку. Касније се, током Чунин Испита, појављује и један од главних негативаца у И делу: Орочимару. Наруто открива да је он С-ранк нестали нинџа и да је врху листе траћених у Конохи. Касније се појављује мистериозна организација Акацуки којој је главни циљ да ухвате Нарута иДеветорепу Демонску Лисицу која се налази у њему.
Најважнији тренутак у серији је Саскеов одлазак из Конохе. Стално размишљање о свом брату и Нарутово брзо напредовање утицали су на њега да оде да тренира код Орочимаруа како би постао још јачи. Саскеа су на путу чували Орочимаруови помоћници Звучна Четворка који су били веома јаки и представљали су велики проблем за Нарута и његове пријатеље који су имали задатак да врате Саскеа назад у Коноху.Генин тим је морао да се раздвоји када би се борили са неким нинжом. Тако би неко остао да се бори један на један а остали би наставили потеру. Цео тим Генина би вероватно погинуо да им у помоћ нису дошли Гара, Темари и Канкуро. Наруто је био једини који је успео да стигне до Саскеа, али је он одбио да се врати у Коноху, па је Наруто био приморан да се бори са својим пријатељем у веома динамичној борби. У тој борби Наруто губи, јер је Саске био много јачи од њега.
Наруто се враћа у Коноху са мисијом коју није извршио, али он обећава Сакури да ће једног дана вратити Саскеа и да ће све бити као некад.
Наруто и Сакура добијају нове учитеље. Нарута тренира Џираја, а Сакуру тренира Цунаде. Џираја и Цунаде такође имају титулу Легендарних Санина, као и Орочимару. Њих троје су као тинејџери тренирали заједно, а њихов учитељ је био Трећи Хокаге. После три месеца од борбе Нарута и Саскеа (та три месеца представљају неколико епизода, филери), Џираја одводи Нарута далеко од цивилизације како би га тренирао.

Naruto
Korice prvog izdanja mange
NARUTO - ナルト -
Žanr	akcija, avantura, fantazija,komedija, drama, romansa
Manga
Autor	Masaši Kišimoto
Izdavač	Shueisha
Ciljna grupa	Shōnen
Časopis	Akamaru Jump   Shonen Jump
Prvo izlaženje	1999. – pojavljivanje
TV anime
Režiser	Hayato Date
Studio	Studio Pierrot
Licenca	Aniplex   Viz Media
Mreža	Animax, TV Tokyo Game One  Italia 1  ABS-CBN, Hero TV
Prvo prikazivanje	3. oktobar 2002. –8. februara 2007.
Epizode	220

Чак иако је изашао неко време након манге, аниме Наруто се је убрзо приближио тренутној причи из манге, будући да једна аниме епизода покрива један или два манга поглавља. Да би се спречило њихово поклапање једно с другим, аниме призвођачи теже да организују садржаје из манга поглавља у дуге одломке с‘ не тако пуно догађаја, праћене кратким причама, а каткад би се између додао који филер. У време када је Саскево спашавање, део приче који се је завршио код епизоде 135, серија је била врло близу причи из манге. Завршетком тога дела приче, аниме се одмах пребацио на филере тј. додавали су епизоде које се нисе појављивале у манги. Већина филера су приче саме за себе, а неке од њих се протежу и на неколико епизода.Аниме генерално остаје одан манги, обично мијењајући само мање детаље (узроке смрти, губитке делова тела и остале повреде те рана које су морале да буду цензурисане у анимеу због млађих гладалаца) или повећавање и ширење делова који су били заостављени у манги.

Многи данас овај аниме пореде са чувеном Змајевом Куглом, јапанског манга уметника Акире Торијаме. Такође Наруто има много фанова по целом свету што се најбоље види и по броју сајтова који су посвећени овом серијалу. Један од најпопуларнијих енглеских сајтова посвећени Наруту „Наруто Цхуусхин“ креиран је убрзо после појављивања ове манге у Европи, 23. августа 2003. године.

МОЈЕ ДЕЛО